Lepanthes pygmaea Luer, Lindleyana 2: 210. 1987.
Tallos 0.7–1.2 cm, las vainas microscópicamente ásperas. Hojas erectas, 0.5–0.8 × 0.45–0.5 cm, ampliamente elípticas, obtusas en el ápice. Infls. con el pedúnculo 0.1–0.15 cm, más cortas que las hojas, congestionadas. Fls. con los sépalos canela, los pétalos amarillos, el labelo rojo; sépalos agudos en el ápice, enteros, el sépalo dorsal ca. 2 × 0.8 mm, angostamente ovado, los sépalos laterales connatos por ca. 0.75 mm, ca. 1.75 × 0.8 mm, ovados y oblicuos; pétalos ca. 0.25 × 1 mm, bilobulados, los lóbulos divergentes, oblongos y oblicuos, obtusos en el ápice, el lóbulo inferior obtusamente angulado en el margen externo; labelo con láminas ca. 0.5 mm, oblongas y oblicuas, truncadas en el ápice, el apéndice piramidal, grueso, pubescente.
Bosque pluvial y nuboso, 1150–1850 m; vert. Carib. N Cord. de Talamanca (vecindad de Tapantí), vert. Pac. Cord. Central. Fl. mar., may. ENDÉMICA. (Luer et al. 12124, MO)
Las plantas de Lepanthes pygmaea están entre las más pequeñas en el género. Se caracteriza también por sus hojas minúsculas, ampliamente elípticas, infls. más cortas que las hojas y fls. minúsculas, el labelo con láminas diminutas, oblongas y oblicuas, y el apéndice piramidal y pubescente.