| 1. | Plantas cespitosas o con segmentos del rizoma alargados y cada uno terminando en un seudobulbo. |
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| 2. | Seudobulbos, si presentes, apicalmente 1-foliados. |
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| 3. | Plantas con rizomas definidos o cañas separando los seudobulbos; generalmente algunos rizomas aéreos. |
| Maxillaria clave 1 |
| 3. | Plantas claramente cespitosas, sin rizomas alargados o cañas. |
| Maxillaria clave 2 |
| 2. | Al menos algunos seudobulbos apicalmente 2-foliados o más. |
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| 4. | Plantas con frecuencia rastreras, nunca con cañas aéreas. |
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| Maxillaria aciantha |
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| Maxillaria friedrichsthalii |
| Maxillaria scorpioidea |
| 4. | Plantas con cañas verticales, decumbentes o péndulas, aéreas. |
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| 8. | Flores verdosas a blancas, el labelo con mancha roja. |
| Maxillaria acervata |
| Maxillaria ponerantha |
| 7. | Hojas generalmente más de 10 cm. |
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| 9. | Flores rojas a anaranjadas o amarillo-verdosas con tonalidades rojas. |
| Maxillaria triangularis |
| 9. | Flores blancas, verdes a amarillas. |
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| 10. | Sépalos menos de 9 mm. |
| Maxillaria tonsoniae |
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| 11. | Sépalos y pétalos hasta 3 mm de ancho, largamente atenuados. |
| Maxillaria ctenostachya |
| 11. | Sépalos y pétalos más de 5 mm de ancho, oblongo-elípticos. |
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| 12. | Hojas 8-18 mm de ancho; sépalos más de 1.1 cm de ancho. |
| Maxillaria camaridii |
| 12. | Hojas 3-10 mm de ancho; sépalos menos de 1 cm de ancho. |
| Maxillaria pulchra |
| 1. | Plantas siempre con rizomas alargados que carecen de seudobulbos en los ápices, con frecuencia especializados como cañas erectas; seudobulbos, cuando presentes, restringidos a vástagos juveniles en la base de vástagos maduros. |
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| 13. | Láminas foliares hasta 40 × 0.5 cm; plantas péndulas. |
| Maxillaria lueri |
| 13. | Láminas foliares menos de 30 cm; plantas variadas. |
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| 14. | Axilas de las hojas nunca con más de un escapo. |
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| 15. | Sépalos más de 1.6 cm; hojas 2 cm de ancho o más. |
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| 16. | Sépalos menos de 2 cm. |
| Maxillaria alfaroi |
| 16. | Sépalos más de 2.5 cm. |
| Maxillaria inaudita |
| 15. | Sépalos menos de 1.5 cm; hojas menos de 1.3 cm de ancho. |
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| 17. | Labelo espatulado, el lóbulo medio más de 2 veces el ancho del istmo. |
| Maxillaria valerioi |
| 17. | Labelo no como el anterior. |
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| Maxillaria linearifolia |
| 18. | Ovario menos de 1.5 cm. |
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| 19. | Hojas elípticas, delgadas; plantas frecuentemente péndulas. |
| Maxillaria appendiculoides |
| 19. | Hojas lanceoladas cuando largas, coriáceas; plantas en general rígidamente erectas cuando pequeñas. |
| Maxillaria dendrobioides |
| 14. | Al menos algunas axilas de las hojas con más de un escapo. |
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| 20. | Columna hasta 4.5 mm (excluida la antera) o más larga. |
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| 21. | Tallos adultos engrosados cerca del ápice determinado, pero sin formar un seudobulbo caraterístico. |
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| 22. | Sépalos menos de 1.5 cm. |
| Maxillaria repens |
| 22. | Sépalos más de 1.8 cm. |
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| 23. | Lóbulo medio del labelo hasta 1/4 de la longitud del labelo, suborbicular. |
| Maxillaria exaltata |
| 23. | Lóbulo medio del labelo al menos 1/3 de la longitud del labelo, lanceolado-ovado. |
| Maxillaria meridensis |
| 21. | Tallos adultos no todos engrosados hacia el ápice característicamente indeterminado. |
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| 24. | Sépalos laterales connatos. |
| Maxillaria synsepala |
| 24. | Sépalos laterales libres. |
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| 25. | Columna 7 mm (excluida la antera) o más larga. |
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| Maxillaria monteverdensis |
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| Maxillaria amabilis |
| Maxillaria falcata |
| 25. | Columna hasta 6 mm (excluida la antera). |
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| 28. | Sépalos hasta 10.5 mm. |
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| 29. | Sépalos pustulados abaxialmente, ampliamente ovados, obtusos; columna 5-5.5 mm (excluida la antera). |
| Maxillaria aurea |
| 29. | Sépalos no pustulados, oblongo-lanceolados, agudos; columna c. 4 mm (excluida la antera). |
| Maxillaria nicaraguensis |
| 28. | Sépalos c. 12 mm o más. |
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| 30. | Labelo rígido con el pie de la columna, no móvil. |
| Maxillaria tricarinata |
| 30. | Labelo articulado con el pie de la columna, móvil. |
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| 31. | Láminas foliares c. 4 cm de ancho o más anchas, largamente pecioladas por encima de la articulación; sépalos y pétalos blancos. |
| Maxillaria trilobata |
| 31. | Láminas foliares menos de 2.5 cm de ancho, no todas pecioladas; sépalos y pétalos de otro color (no blancos). |
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| 32. | Flores rosadas hasta lavanda oscuro. |
| Maxillaria scalariformis |
| 32. | Sépalos y pétalos rojo ladrillo o verdes, el labelo blanco con manchas púrpura. |
| Maxillaria tonduzii |
| 20. | Columna hasta 4.2 mm (excluida la antera). |
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| 33. | Pie menos de 1/5 de la longitud de la columna. |
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| 34. | Hojas más de 3 cm de ancho. |
| Maxillaria trilobata |
| 34. | Hojas menos de 2 cm de ancho. |
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| 35. | Hojas agudas; columna c. 2 mm. |
| Maxillaria adendrobium |
| 35. | Hojas obtusas y desigualmente 2-lobadas; columna c. 4 mm. |
| Maxillaria nicaraguensis |
| 33. | Pie al menos 1/5 de la longitud de la columna. |
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| 36. | Sépalos menos de 1 cm. |
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| Maxillaria allenii |
| 37. | Sépalos menos de 7 mm. |
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| 38. | Labelo con característicos lóbulos basales laterales, redondeados. |
| Maxillaria conduplicata |
| 38. | Labelo sin lóbulos basales laterales. |
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| 39. | Flores rojo brillante con labelo amarillo. |
| Maxillaria fulgens |
| 39. | Flores color malva a rosado. |
| Maxillaria pittieri |
| 36. | Sépalos más de 1.1 cm. |
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| 40. | Labelo continuo con el pie de la columna, más o menos rígido, sin formar un ángulo agudo. |
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| 41. | Labelo en la base con un callo simple sin adornos. |
| Maxillaria biolleyi |
| 41. | Labelo en la base con quillas, papilas o verrugas, además de un callo carnoso. |
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| 42. | Labelo subsacciforme; ovario hasta 11 mm. |
| Maxillaria adolphi |
| 42. | Labelo no sacciforme; ovario más de 11 mm. |
| Maxillaria quadrata |
| 40. | Labelo formando un ángulo agudo con el pie de la columna y en general fácilmente móvil. |
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| 43. | Hojas pecioladas por encima de la articulación, ampliándose abruptamente hacia la lámina elíptica. |
| Maxillaria trilobata |
| 43. | Hojas no característicamente pecioladas. |
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| 44. | Ovario más pedicelo 0.4-0.6 cm. |
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| 45. | Labelo pandurado; plantas conocidas del oeste del Canal de Panamá. |
| Maxillaria allenii |
| 45. | Labelo igualmente 3-lobado; plantas conocidas del Cerro Jefe (Panamá) hasta Colombia. |
| Maxillaria fragrans |
| 44. | Ovario con pedicelo c. 0.6 cm o más. |
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| 46. | Sépalos 4-5 mm de ancho, columna 2-2.5 mm. |
| Maxillaria parvilabia |
| 46. | Sépalos 7-7.5 mm de ancho, columna c. 4 mm. |
| Maxillaria tutae |